O comando iconv é ideal para modificar a codificação do conteúdo mas para o nome descobri
o comando convmv
convmv -f iso-8859-1 -t utf-8 -r *
Ele pode fazer coisas do tipo:
convmv -f latin1 -t utf-8 -r --exec ``echo #1 renomeado para #2'' /caminho/para/os/arquivos
A opção "-r" faz a recursividade
Referências:
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